Where i can find a simple tutorial for qpAdm?

[Jingle Bell]

I searched on google but i find very very few and they are just too hard, so if anyone have a simple tutorial to learn how use/install i would apreciatte a lot, im curious to compare same models in g25 and qpAdm to see if have such a diference btw both and test some models with a tool which is know to have a scientific use.

Ty for read, have a nice day.

[Laredo]

Maybe In Anthrogenica they are into that too?

[Jingle Bell]

Maybe In Anthrogenica they are into that too?

I searched in Eupedia and Anthrogenica, but i did not find any :p

[Jingle Bell]

Bump

[Beowulf]

I searched in Eupedia and Anthrogenica, but i did not find any :p

Maybe you can PM Ruderico in anthrogenica i think he uses qpAdm for his calculators i think he can help u.


I would like to try it too but i don't have windows so for me would be more hard

[gixajo]

I searched on google but i find very very few and they are just too hard, so if anyone have a simple tutorial to learn how use/install i would apreciatte a lot, im curious to compare same models in g25 and qpAdm to see if have such a diference btw both and test some models with a tool which is know to have a scientific use.

Ty for read, have a nice day.



A user guide for qpAdm is now available in the supplementary materials for "Assessing the Performance of qpAdm: A Statistical Tool for Studying Population Admixture" by Harney et al. (2020).
https://gsajournals.figshare.com/articles/dataset/Supplemental_Material_for_Harney_et_al_2020/13403225?file=26425355

https://doi.org/10.25386/genetics.13403225.v2

If my links doesn´t work try those same links from this site:

https://github.com/DReichLab/AdmixTools

[Beowulf]

If my links doesn´t work try those same links from this site:

https://github.com/DReichLab/AdmixTools

Una pregunta es solo para windows o tambien se puede hacer con Linux de alguna manera?

[gixajo]

Una pregunta es solo para windows o tambien se puede hacer con Linux de alguna manera?

No sabría decirte porque no soy usuario de Linux ni de qpadm, pero generalmente suele haber versiones para los dos, incluso muchos de este tipo de software suele salir inicialmente para Linux y posteriormente se adapta a windows.

Aparte de PAST/PLINK tampoco he usado mucho software relacionado con todo esto. Y tampoco sé sacarle todo el partido a esos dos, solo he jugueteado un poquillo...

En Anthrogenica hay bastante gente que sabe del tema (Anglesqueville, Vbnektio...?), incluso hay un español que sabe bastante. Aquí aparte de Nganassan que igual es Vbnektio en AG y aquí no sé ni si sigue, creo que ninguno.

[Beowulf]

No sabría decirte porque no soy usuario de Linux ni de qpadm, pero generalmente suele haber versiones para los dos, incluso muchos de este tipo de software suele salir inicialmente para Linux y posteriormente se adapta a windows.

Aparte de PAST/PLINK tampoco he usado mucho software relacionado con todo esto. Y tampoco sé sacarle todo el partido a esos dos, solo he jugueteado un poquillo...

En Anthrogenica hay bastante gente que sabe del tema (Anglesqueville, Vbnektio...?), incluso hay un español que sabe bastante. Aquí aparte de Nganassan que igual es Vbnektio en AG y aquí no sé ni si sigue, creo que ninguno.

interesante pues mirare a ver por que yo tengo un Chromebook pero que tambien usa Linux al mismo tiempo y lo usaba para ciertos codigos ya sea de algun juego o algo de programación muy basica

[kingmob]

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