Printable View
Rumiante:
Target: Juan
Distance: 3.2143% / 0.03214277 | ADC: 0.25x
59.2 TUR_Barcin_N
29.6 Yamnaya_RUS_Samara
4.4 IRN_Shahr_I_Sokhta_BA2
4.2 MAR_Taforalt
2.6 LUX_Loschbour
Saco más gitano que de Loschbour, ni Camarón, el Cigala e Isabel Pantoja.
Bixajo:
Target: Juan_scaled
Distance: 2.8226% / 0.02822595
91.6 Iberian
5.2 Berber
3.2 Indian
Recuerda que ya el yamnaya es como 15% WHG, ahí te está quitando bastante, utiliza 0.5 a ver.Quote:
Originally Posted by Defcon2
Target: JuanQuote:
Originally Posted by Rocinante
Distance: 3.5347% / 0.03534730 | ADC: 0.5x
63.6 TUR_Barcin_N
30.4 Yamnaya_RUS_Samara
5.2 IRN_Shahr_I_Sokhta_BA2
0.8 MAR_Taforalt
:yuck:
Te disparo la distancia. Olvidalo, esa si que no te sirvio.Quote:
Originally Posted by Defcon2
Unscaled es bastante italiano comparado con escala.Quote:
Originally Posted by Rocinante
Target: Juan
Distance: 3.1919% / 0.03191896
58.4 TUR_Barcin_N
31.2 Yamnaya_RUS_Samara
5.8 MAR_Taforalt
4.6 WHG
Target: Juan_scaled
Distance: 4.8997% / 0.04899692
54.8 TUR_Barcin_N
29.4 Yamnaya_RUS_Samara
9.8 WHG
6.0 MAR_Taforalt
Que distancias mas grandes tío... Madre mía.Quote:
Originally Posted by Defcon2
Cuando tu usas el K15 o K36 de gedmatch, cuántos SNP te genotipan? A mi aprox. unos ~160.000 con mi nueva raw fusionada, y a tí?
Entre 50000 y 60000.
https://i.imgur.com/IUoQSKP.png
https://i.imgur.com/Gzl1rwg.png
Que dices amigo... Ahi tienes posiblemente la respuesta del porque sacas unas distancias y (a veces) unos resultados tan extraños. Yo se que mi raw data de ahora es muy potente por haber mezclado tantos SNPs diferentes, pero no esta demas: 179867 SNPs used in this evaluation, este en mi caso del K15.Quote:
Originally Posted by Defcon2
Es muy extraño, has intentado pasar ese archivo y convertirlo en .CSV? No creo que haga milagros pero a saber si hace algo mejor, o tambien usar el Admixture Studio que esta de puta madre, es como un Gedmatch pero de escritorio y actualizado, y esa propia APP te dice en cada calculadora la ratio de genotipacion, a mi siempre me marca un ~97.5%, que esta muy bien, creo que a partir de ~90% esta bien. Intentalo a ver.
En el k36 yo tengo: 52241 SNPs used in this evaluation
K15:Quote:
Originally Posted by Rocinante
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-- DIY Dodecad v 2.1 --------------------------------------
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----- Dienekes' Anthropology Blog -------------@@----------
-------- http://dienekes.blogspot.com ---------@@----------
----- The Dodecad Ancestry Project ------------@@@@@@@@@---
-------- http://dodecad.blogspot.com ----------------------
-----------------------------------------------------------
15 ancestral populations
184719 total SNPs
161 flipped SNPs
21410 heterozygous SNPs
429 no-calls
125024 absent SNPs
0.320844 genotype rate
mode genomewide
125453 SNPs missing (no-call or absent)
250 dQ: 3.022E-04 goal: 1.000E-07
500 dQ: 1.197E-04 goal: 1.000E-07
750 dQ: 4.688E-05 goal: 1.000E-07
1000 dQ: 2.052E-05 goal: 1.000E-07
1250 dQ: 1.528E-05 goal: 1.000E-07
1500 dQ: 1.120E-05 goal: 1.000E-07
1750 dQ: 8.245E-06 goal: 1.000E-07
2000 dQ: 6.147E-06 goal: 1.000E-07
2250 dQ: 4.657E-06 goal: 1.000E-07
2500 dQ: 3.865E-06 goal: 1.000E-07
2750 dQ: 3.291E-06 goal: 1.000E-07
3000 dQ: 2.830E-06 goal: 1.000E-07
3250 dQ: 2.455E-06 goal: 1.000E-07
3500 dQ: 2.145E-06 goal: 1.000E-07
3750 dQ: 1.888E-06 goal: 1.000E-07
4000 dQ: 1.671E-06 goal: 1.000E-07
4250 dQ: 1.488E-06 goal: 1.000E-07
4500 dQ: 1.331E-06 goal: 1.000E-07
4750 dQ: 1.195E-06 goal: 1.000E-07
5000 dQ: 1.078E-06 goal: 1.000E-07
5250 dQ: 9.760E-07 goal: 1.000E-07
5500 dQ: 8.863E-07 goal: 1.000E-07
5750 dQ: 8.072E-07 goal: 1.000E-07
6000 dQ: 7.371E-07 goal: 1.000E-07
6250 dQ: 6.748E-07 goal: 1.000E-07
6500 dQ: 6.191E-07 goal: 1.000E-07
6750 dQ: 5.692E-07 goal: 1.000E-07
7000 dQ: 5.244E-07 goal: 1.000E-07
7250 dQ: 4.839E-07 goal: 1.000E-07
7500 dQ: 4.472E-07 goal: 1.000E-07
7750 dQ: 4.140E-07 goal: 1.000E-07
8000 dQ: 3.837E-07 goal: 1.000E-07
8250 dQ: 3.561E-07 goal: 1.000E-07
8500 dQ: 3.309E-07 goal: 1.000E-07
8750 dQ: 3.078E-07 goal: 1.000E-07
9000 dQ: 2.866E-07 goal: 1.000E-07
9250 dQ: 2.671E-07 goal: 1.000E-07
9500 dQ: 2.492E-07 goal: 1.000E-07
9750 dQ: 2.327E-07 goal: 1.000E-07
10000 dQ: 2.174E-07 goal: 1.000E-07
10250 dQ: 2.033E-07 goal: 1.000E-07
10500 dQ: 1.902E-07 goal: 1.000E-07
10750 dQ: 1.781E-07 goal: 1.000E-07
11000 dQ: 1.668E-07 goal: 1.000E-07
11250 dQ: 1.564E-07 goal: 1.000E-07
11500 dQ: 1.466E-07 goal: 1.000E-07
11750 dQ: 1.376E-07 goal: 1.000E-07
12000 dQ: 1.292E-07 goal: 1.000E-07
12250 dQ: 1.213E-07 goal: 1.000E-07
12500 dQ: 1.140E-07 goal: 1.000E-07
12750 dQ: 1.071E-07 goal: 1.000E-07
13000 dQ: 1.007E-07 goal: 1.000E-07
13029 total iterations
9.999E-08 final dQ
----------------------------
FINAL ADMIXTURE PROPORTIONS:
----------------------------
19.45% North_Sea
31.42% Atlantic
2.33% Baltic
2.58% Eastern_Euro
25.54% West_Med
0.04% West_Asian
9.69% East_Med
2.29% Red_Sea
1.96% South_Asian
0.72% Southeast_Asian
0.00% Siberian
0.00% Amerindian
0.70% Oceanian
0.15% Northeast_African
3.13% Sub-Saharan
CPU time = 358.09 sec
Admixture calculation finished!