Genética de españoles e hispanoamericanos

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09-01-2020, 12:19 PM
Defcon2

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Originally Posted by gixajo

Mi idea era hacer varias medias con los K13 de los miembros ibéricos del foro:

Spanish:1= media de los miembros(y miembras) españoles
Portuguese:1=media de los miembros portugueses
Iberian:1=media Spanish:1+Portuguese:1
Spanish:2=media miembros españoles+media regiones españolas "oficiales"
Portuguese:2=media miembros portugueses+media portuguesa "oficial"
Iberian:2=media de Spanish:2+Portuguese:2

Pero la mierda del Apache office no me deja pasar las coordenadas a tabla, y como tenga que poner tantas coordenadas a mano de una en una en una tabla, me puedo estar 10 horas para hacer todo esto.

Si alguien puede hacer estas medias sencillitas con una hoja de cálculo de verdad, seria de agradecer, esta tarde tengo funeral y mañana cumpleaños, y no se cuando me pondré a solucionar el problemilla del Apache.

Esta tarde tengo funeral, mañana cumpleaños y pasado me voy de viaje, combo perfecto de planes para esta semana salu2 y denle like :thumb001:

Si me pasas todas las coordenadas que tengas puede que haga algunos.
09-01-2020, 02:42 PM
gixajo

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Originally Posted by Defcon2

Esta tarde tengo funeral, mañana cumpleaños y pasado me voy de viaje, combo perfecto de planes para esta semana salu2 y denle like :thumb001:

Si me pasas todas las coordenadas que tengas puede que haga algunos.

Las posteé todas unos post antes que este, están en la anterior página, pero ya solucioné como hacerlo, e hice la de los once españoles:

Code:

Spanish:1,41.08,10.13,28.58,2.01,11.22,3.44,0.53,0.20,0.26,0.23,0.44,0.99,0.68

Mira a ver si te sale lo mismo.

Me ayudé con este programilla, que también puede leer SNP´s y está en español, usa el pgrograma R como auxiliar:

https://www.infostat.com.ar/

Con el datasheet del K13 updated

Target: Spanish:1
Distance: 0.0859% / 0.08590682
16.8 Spanish_Aragon
13.4 French_Basque
9.8 FRA_Aquitania
9.0 Southwest_French
8.6 Spanish_Extremadura
5.4 Southwest_English
5.4 Spanish_Galicia
4.6 Sardinia
4.4 North-Dutch
4.0 Spanish_Castilla_Y_Leon
3.8 Spanish_Cantabria
3.8 Swiss_Italian
2.4 Saudi
1.8 Sardinian
1.6 Moroccan
1.4 Algerian
1.0 Mozabite_Berber
0.6 Portuguese
0.6 Spanish_Castilla_La_Mancha
0.6 Sweden_Svealand_West
0.4 AostaValley
0.4 South_Dutch
0.2 Papuan

Pero nos salen unas distancias bastante altas, así que habrá que mezclarlo con la media de las regiones españolas.

Ahora te pongo todas las coordenadas que posteé.
09-01-2020, 02:43 PM
gixajo

Españoles(11)

Code:

Spaniard 2.0(Spanish),40.79,12.54,23.00,4.94,12.74,2.11,0,0,1.63,0,0 .87,1.37,0 Helen(Spaniard),37.16,9.88,28.16,4.72,13.66,3.10,0 .65,0.00,0.00,0.00,0.76,1.86,0.00 Defcon2(Spain),40.02,7.80,30.16,0.00,12.56,2.29,2. 03,1.31,0.00,0.00,0.73,0.00,3.11 gixajo(Spain),41.06,11.68,30.06,2.10,7.08,5.14,0.9 0,0,0,0,0.76,1.24,0 gixajo_dad(Spain),37.51,10.67,30.89,0.89,11.26,5.2 3,0,0,0,0.17,0.65,1.43,1.28 gixajo_mom(Spain),45.20,11.73,29.98,0,8.19,2.57,0. 67,0,0,0,0.48,0,1.17 gixajo_father_uncle(Spain),40.33,8.07,29.68,1.68,10.13,5.70,1.22,0,0,0.95,0.07,0.76,1.41 gixajo_father_cousin(Spain),45.99,9.31,28.93,0,10.61,2.23,0,0.83,0,0,0.52,1.33,0.25 Ibericus(spaniard),40.18,11.72,25.49,1.37,15.92,3. 30,0,0.84,0,0.28,0,0.57,0.33 Gold_fenix(spaniard),42.91,8.03,29.07,0.61,14.43,3 .08,0.41,0.29,0,1.17,0,0,0 Gallop(spanish),40.81,10,29.04,5.78,6.81,3.11,0,0,1.32,0,0,2.34,0

Portugueses(16)

Code:

Pedro(Portuguese),36.29,12.40,23.67,1.85,13.80,4.8 8,0,0,0.56,1.19,0,2.41,2.95 FilhoV(portuguese),36.9,9.37,26.86,2.73,15.65,3.36 ,0,0,0,0.78,0.45,1.87,2.04 Luso(portuguese),39.92,11.77,24.77,0,14.32,3.43,0.29,0,0.83,0. 33,0.12,2.74,1.46 Damiao(Portuguese),38.48,11.12,25.02,4.28,13.99,2. 18,0.36,0,0,0,1.08,1.60,1.88 Tagus(portuguese),39.97,7.43,23.43,3.59,17.30,3.21 ,0,0,0,0.59,0,0.16,4.30 Brás(portuguese),36.74,11.53 ,25.72,4.50,14.12,2.75,0,0,0.95,0,0.77,2.48,0.43 Vasconcelos(portuguese),39.48,9.61,28.50,1.02,12.0 3,4.45,0,0.58,0.58,0,0,2.60,1.13 Brás_father(portuguese),35.7 0,15.45,24.57,0.58,15.64,1.80,0.58,0,0.79,0.38,1.0 4,2.51,0.96 Hyoga7(portuguese),39.02,11.85,23.71,1.1,15.39,3.0 1,0.69,1.07,0.29,0.4,0.13,0.46,2.88 Mrs_Vasconcelos(portuguese),39.44,9.89,26.48,1.66, 13.70,3.51,1.48,0.88,0.41,0,0.57,0.18,1.80 Brás_GF(portuguese),40.91,9. 75,25.89,1.64,13.24,2.41,0.45,0.78,0.2,1.44,0.2,0. 47,2.63 Luso_MOM(Portugeuse),37.79,11.85,25.26,2.02,13.71,2.49,1.2 1,0,0.26,0.94,0,2.92,1.54 Luso_DAD(Portugeuse),40.04,11.16,26.49,1.35,14.00,2.59,0,0,0,0.84,0,2.48,1.02 Luso_BRO(Portuguese),37.13,11.90,26.17,1.17,14.5,2.62,1.04,0,0.20,0.54,0,2.33,2.4 Luso_SIS(Portuguese),35.65,10.83,27.88,3.63,13.45,3.14,.28,0,0,1.27,0,2.01,1.85 Ruderico(portuguese),39.48,9.61,28.50,1.02,12.0 3,4.45,0,0.58,0.58,0,0,2.60,1.13

Referencias "oficiales":

Code:

Portuguese,38.54,11.51,25.32,2.43,13.90,3.63,0.42,0.14,0.25,0.44,0.67,1.72,1.04

Code:

Spanish_Andalucia,39.07,8.19,29.07,3.83,14.11,1.95,0.60,0.29,0.63,0.02,0.40,1.28,0.57 Spanish_Aragon,43.83,8.27,29.79,1.32,12.05,2.37,0.40,0.25,0.50,0.32,0.39,0.46,0.04 Spanish_Cantabria,41.79,11.49,29.27,1.75,10.20,2.37,0.45,0.03,0.13,0.49,0.47,0.80,0.75 Spanish_Castilla_La_Mancha,41.09,9.37,28.52,2.72,12.42,2.88,0.47,0.22,0.21,0.31,0.08,1.42,0.29 Spanish_Castilla_Y_Leon,40.76,11.13,26.09,1.86,12.82,3.49,0.04,0.51,0.05,0.28,0.18,2.01,0.78 Spanish_Cataluna,41.36,12.13,25.78,3.08,13.09,1.51,0.69,0.59,0.06,0.06,0.43,0.45,0.77 Spanish_Extremadura,38.27,9.67,26.84,3.32,13.73,4.26,0.65,0.00,0.00,0.62,0.20,1.23,1.22 Spanish_Galicia,38.51,12.18,26.23,1.97,11.93,4.55,1.49,0.36,0.22,0.14,0.00,1.26,1.16 Spanish_Murcia,40.15,9.33,26.12,2.21,14.57,2.92,0.21,0.88,0.67,0.60,0.11,1.44,0.78 Spanish_Valencia,40.54,10.58,27.72,1.90,14.85,1.32,0.88,0.29,0.04,0.41,0.50,0.31,0.65
09-01-2020, 02:44 PM
gixajo

Y ahora me voy a afeitar, duchar y cambiar, que enseguida iremos a Vitoria al funeral.:picard1:
09-01-2020, 03:34 PM
Defcon2

Quote:

Originally Posted by gixajo

Las posteé todas unos post antes que este, están en la anterior página, pero ya solucioné como hacerlo, e hice la de los once españoles:

Code:

Spanish:1,41.08,10.13,28.58,2.01,11.22,3.44,0.53,0.20,0.26,0.23,0.44,0.99,0.68

Mira a ver si te sale lo mismo.

Me ayudé con este programilla, que también puede leer SNP´s y está en español, usa el pgrograma R como auxiliar:

https://www.infostat.com.ar/

Con el datasheet del K13 updated

Target: Spanish:1
Distance: 0.0859% / 0.08590682
16.8 Spanish_Aragon
13.4 French_Basque
9.8 FRA_Aquitania
9.0 Southwest_French
8.6 Spanish_Extremadura
5.4 Southwest_English
5.4 Spanish_Galicia
4.6 Sardinia
4.4 North-Dutch
4.0 Spanish_Castilla_Y_Leon
3.8 Spanish_Cantabria
3.8 Swiss_Italian
2.4 Saudi
1.8 Sardinian
1.6 Moroccan
1.4 Algerian
1.0 Mozabite_Berber
0.6 Portuguese
0.6 Spanish_Castilla_La_Mancha
0.6 Sweden_Svealand_West
0.4 AostaValley
0.4 South_Dutch
0.2 Papuan

Pero nos salen unas distancias bastante altas, así que habrá que mezclarlo con la media de las regiones españolas.

Ahora te pongo todas las coordenadas que posteé.

Más o menos igual, lo que cambia es el redondeo.

Code:

K1311Españoles,41,10.13,28.58,2,11.22,2.44,0.45,0.29,0.26,0.23,0.44,0.99,0.68

Target: K1311Españoles
Distance: 0.3341% / 0.33411176
15.2 Spanish_Aragon
11.6 Spanish_Murcia
11.4 French_Basque
9.4 North-Dutch
8.8 FRA_Aquitania
6.6 Spanish_Extremadura
6.0 Sardinian
5.4 Southwest_French
3.6 Spanish_Castilla_La_Mancha
2.8 Spanish_Galicia
2.6 Portuguese
2.4 Spanish_Valencia
2.2 Spanish_Andalucia
2.2 Swiss_Italian
2.0 Spanish_Cantabria
1.2 Algerian
1.2 Sardinia
1.2 Swiss-Italian2
0.8 Moroccan
0.6 Mozabite_Berber
0.6 Turk_Kavala
0.4 Moroccan_Jew
0.4 NAN_Melanesian
0.4 North-Swedish
0.2 Ethiopian_Tigray
0.2 Mandenka
0.2 Somali
0.2 Turk_Cypriot
0.2 West_German
09-01-2020, 03:42 PM
gixajo

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Originally Posted by Defcon2

Más o menos igual, lo que cambia es el redondeo.

n

Duchado, vestido y afeitado. A las seis nos iremos al funeral.

¿Como pasas las coordenadas del K13 a tabla de forma rápida?

Ya tenía el truco cogido a las del G25, pero nosé porqué, no funciona con las del K13, y eso que son un juego de niños en comparación.

Ahora las paso de texto a tabla con el programa ese,y luego exporto las tablas al sucedáneo gratuito de Excell del Apache, y ahí ya pongo la fórmula y salen rápido.

Por cierto, ese programilla, igual que el R, lee SNP´s en formato txt, no me he puesto a investigar más que un poco, pero habrá que hacerlo. Incluso tiene opción de convertir coordenadas y montones de gráficas y PCAs, aunque se supone que el funcionamiento es intuitivo, el manual de uso parece el Quijote...
09-01-2020, 03:59 PM
Defcon2

Quote:

Originally Posted by gixajo

Duchado, vestido y afeitado. A las seis nos iremos al funeral.

¿Como pasas las coordenadas del K13 a tabla de forma rápida?

Ya tenía el truco cogido a las del G25, pero nosé porqué, no funciona con las del K13, y eso que son un juego de niños en comparación.

Ahora las paso de texto a tabla con el programa ese,y luego exporto las tablas al sucedáneo gratuito de Excell del Apache, y ahí ya pongo la fórmula y salen rápido.

Por cierto, ese programilla, igual que el R, lee SNP´s en formato txt, no me he puesto a investigar más que un poco, pero habrá que hacerlo. Incluso tiene opción de convertir coordenadas y montones de gráficas y PCAs, aunque se supone que el funcionamiento es intuitivo, el manual de uso parece el Quijote...

Yo pongo las coordenadas en un .txt, copio y pego desde ahí y luego lo pego en el Mapache, me sale una ventana con varias opciones a elegir y pongo que separado por comas. Truco barato pero funciona.
09-01-2020, 04:18 PM
Defcon2

Quote:

Originally Posted by gixajo

Y ahora me voy a afeitar, duchar y cambiar, que enseguida iremos a Vitoria al funeral.:picard1:

X cierto parece que van actualizar/actualizando el algoritmo de 23andme añadiendo más referencias, tú qué versión tienes del chip?
09-02-2020, 07:35 PM
mitalit

Quote:

Originally Posted by Defcon2

X cierto parece que van actualizar/actualizando el algoritmo de 23andme añadiendo más referencias, tú qué versión tienes del chip?

Como lo sabes?
09-02-2020, 08:04 PM
Defcon2

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Originally Posted by Spaniard 2.0

Como lo sabes?

https://anthrogenica.com/showthread....update-23andMe