Nuestros resultados como Bellotiland en vez de Andalucía:
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Nuestros resultados como Bellotiland en vez de Andalucía:
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Si, aunque me sucede algo curioso, con los belloteros me aparece Álava pero no con CyL ni los Mozárabes, creo que soy más norteño que la referencia extremeña del datasheet aunque lo achaco a la falta de suficientes muestras para representar mejor la variabilidad genética interna de la región de los embutidos.
Target: Juan_scaled
Distance: 3.2920% / 0.03291997
88.8 Extremadura
11.2 Álava
Target: Juan_scaled
Distance: 3.0607% / 0.03060658
100.0 Andalucia
Target: Juan_scaled
Distance: 2.9105% / 0.02910453
100.0 Castilla_Y_Leon
Seguro que hay variaciones importantes dentro de Extremadura, es una región bastante extensa.
De todas formas no nos quejemos muchos, que tenemos referencias españolas para dar y tomar, aunque siempre son mejorables.
Ahora que me doy cuenta, puedo hacer una megareferencia riojana con los samples individuales(o sample, porque igual solo hay uno) del datasheet oficial y los diez nuevos samples de este último estudio.
Una referencia riojana, a medio camino entre Cantabria y Aragón, que eran las dos referencias que mejor me iban en el antiguo datasheet, tiene que darme un porcentaje enrome en cualquier resultado.
Por cierto, no sé si te dije, que dejé de hacer las medias en tablas del procesador detextos y las hago ya en una hoja de cálculo del Apache, es copiar y pegar la lista de referencias, poner la fórmula,cambiar varias configuraciones, arrastrar fórmula, volver a cambiar configuraciones, etc y se tarda nada y puedes hacer medias del número que quieras de referencias en nada de tiempo.
Siempre y cuando las referencias no te las pasen con espacios en blanco, entonces cuando compruebes en vahaduo si están bien las distancias y los % te saldrán mal.
El método anterior era efectivo para percatarse de los fallos, así que en caso de que te pasen mal las referencias, viene bien .
Lo que hago es copiar y pegar las coordenadas desde un bloc de notas o Vahaduo directamente separándolos por comas, cambiar el número de división de la fórmula para hacer la media según la cantidad de samples y para finalizar reemplazar manualmente los espacios del average por comas ya en Vahaduo, esto último es lo mas tedioso, si pudiese hacerlo de otra manera sería perfecto... pero me da pereza cambiar el método.
Probaste esto?
https://phenotype.yseq.net/
YSEQ casi acierta mi fenotipo:
https://i.imgur.com/dPjcqIb.png
Tu que eres vasco sin apenas influencia moruna y subsahariana seguro que sacas piel blanca.
No te burles de mí!!! Sabes perfectamente que soy medio andaluz, y que hasta mi lado alavés tiene moruno!!!:D
Aparte de que incluso los supervascos con 0% Canarian Guanche pueden ser tan oscuros como el mondongo de un senegalés.
No lo había probado, ahora le echo un vistazo.
Joder pero los alaveses muy poco, el resto somos mitad ibéricos + NA + Romano completamente, tu solo la parte paterna. :D
https://ars.els-cdn.com/content/imag...003493-gr4.jpg
https://www.theapricity.com/forum/sh...of-the-Basques
Que por cierto siempre pensé que la aportación mediterránea como el mismo nombre indica se limitaba a la costa sureña y oriental pero en muchas ocasiones las poblaciones del interior tienen más cantidad, las principales ciudades griegas fueron de la costa oriental (Sagunto y Empúries) y las fenicias por toda la costa andaluza/murciana. La excepción serían los romanos pero estoy seguro que daban prioridad a las costas o se ubicaban en mayor numero allí.
Target: Gallop_scaled
Distance: 2.1475% / 0.02147469
79.2 Andalucia
18.4 Vizcaya
2.4 Álava
Distance to: Gallop_scaled
0.02269035 Andalucia
0.03320776 Navarra
0.03383254 Álava
0.03546310 Vizcaya
0.04320741 Guipúzcoa
Ves como sí son para nosotros estas muestras gixi. Mi vasco es vizcaíno, por favor los tenía olvidados, si no hablan de Vizcaya ni en las noticias.
Lo posteé en el otro foro también.
La portuguesa es provisional, porque tengo un montón de K13 portugueses que me pasaron amablemente, y apenas he pasado unos pocos individuos al formato de coordenadas de vahaduo.
Y las primeras provinciales o regionales españolas (voy por orden alfabético), alguna solo tiene dos. En la alavesa al final no añadí a mi madre, ni otro sample individual que encontré a través de Gedmatch.Code:Portugal(n=13),38.33,11.17,25.67,2.35,13.59,3.31,0.20,0.15,0.27,0.56,0.29,2.20,1.91
A ver si os funcionan bien, aún puedo hacer alguna más.Code:Asturias(n=3),41.82,10.32,27.78,1.66,11.54,3.32,0.00,0.67,0.26,0.26,0.90,1.04,0.43
Álava(n=4),48.52,9.15,29.17,0.44,8.44,1.69,0.34,0.39,0.04,0.29,0.35,0.61,0.59
Andalucía_Oriental(n=6),38.57,9.77,29.37,1.82,12.22,4.53,0.47,0.16,0.04,0.28,0.43,1.01,1.34
Andalucía_Occidental(n=4),38.89,9.72,27.55,2.66,13.74,2.94,0.14,0.58,0.43,0.28,0.36,1.70,1.03
Cantabria(n=2),42.14,11.70,29.22,0.25,11.48,2.13,0.26,0.00,0.36,0.50,0.39,1.46,0.14
Castilla_y_León(n=4),39.68,11.09,26.59,1.92,13.90,2.69,0.29,0.14,0.12,0.55,0.53,1.96,0.54
Si alguno puede pasarme al menos un gallego (solo tengo uno), y mejor dos o tres, estaría bien.
No tengo ningún catalán ni valenciano, ni balear,aunque hay para hacer una referencia de Castellón.
Tengo mezclados aragoneses, pero ninguno 100% (que yo sepa, porque tengo muchos individuos que no sé cuales son sus orígenes).
No incluí a mi madre en la media alavesa, pero a mi padre y a mi tío abuelo en la andaluza oriental sí los incluí.
No he elegido medias para buscar un resultado medianamente lógico con mis padres o conmigo, acabo de probar todas las referencias que he hecho ahora mismo por primera vez.
Tampoco he tomado como referencia las medias regionales ya existentes en el datasheet (aunque las he probado con ellas para ver si se parecen).
He hecho medias fiándome de los orígenes atribuidos con que me las han pasado, y he quitado aquellos que me ha parecido que debía quitar de la media para evitar solapamientos.
Tiene bastante lógica por ahora, pero según se vayan añadiendo más referencias de otras partes, los resultados irán cambiando.
Target: gixajo
Distance: 5.0567% / 5.05674222 | R2P
66.6 Andalucía_Oriental(n=6)
33.4 Álava(n=4)
Distance to: gixajo
5.71505031 Asturias(n=3)
5.89144295 Cantabria(n=2)
6.28031050 Andalucía_Oriental(n=6)
8.18349559 Andalucía_Occidental(n=4)
8.27116679 Castilla_y_León(n=4)
8.85811492 Portugal(n=13)
8.98981646 Álava(n=4)
*************************************
Target: gixajo_dad
Distance: 2.6475% / 2.64747049 | R2P
100.0 Andalucía_Oriental(n=6)
Distance to: gixajo_dad
2.64747049 Andalucía_Oriental(n=6)
5.40947317 Andalucía_Occidental(n=4)
5.84395414 Asturias(n=3)
6.08513763 Cantabria(n=2)
6.24201890 Castilla_y_León(n=4)
6.38941312 Portugal(n=13)
12.19416254 Álava(n=4)
*************************************
Target: gixajo_mom
Distance: 2.8364% / 2.83635898 | R2P
53.7 Álava(n=4)
46.3 Cantabria(n=2)
Distance to: gixajo_mom
4.52078533 Álava(n=4)
4.97700713 Cantabria(n=2)
5.96922943 Asturias(n=3)
8.53009965 Andalucía_Oriental(n=6)
9.13229982 Castilla_y_León(n=4)
9.56978056 Andalucía_Occidental(n=4)
10.36196410 Portugal(n=13)