Question: Can I predict my mtDNA Haplogroup from MyHeritage raw data?

[Katarzyna]

I think it requires raw data to be converted to FASTA. But I think you need to do raw data -> VCF, and then VCF -> FASTA (from what I saw on the internet)

where can I convert it?

[Beowulf]

As far as i know MH raw data doesn't contain mtdna related snp's i think

[Katarzyna]

As far as i know MH raw data doesn't contain mtdna related snp's i think

what about ancestrydna ?

[Beowulf]

what about ancestrydna ?

idk about ancestrydna, i only know that you can use 23andMe raw data in this predictor https://dna.jameslick.com/mthap/

[true_southron]

where can I convert it?

I did not find a single website. You would have to install some third party github tools/scripts on your local PC, but I am not 100% it would work for other than 23andme raw data.

However, if someone wants to experiment, he/she would install GATK, convert MyHeritage raw data to VCF format. Once successfully converted to VCF, he/she would use this scripts to convert to 23 and me.

Perhaps that would work with the website Beowulf provided

Good luck!

[rothaer]

idk about ancestrydna, i only know that you can use 23andMe raw data in this predictor https://dna.jameslick.com/mthap/

(...)

True and you can easily convert the AncestryDNA raw data to the 23andMe format with the DNA Kit Studio: https://www.dnagenics.com/dna-kit-studio/

The AncestryDNA raw data does contain mtDNA information.

[Katarzyna]

True and you can easily convert the AncestryDNA raw data to the 23andMe format with the DNA Kit Studio: https://www.dnagenics.com/dna-kit-studio/

The AncestryDNA raw data does contain mtDNA information.

Ok, honestly I never did a haplogroup test, only my male relative did it so I know my paternal haplogroups (Y-DNA: I2a1, and mt-DNA: U5a2b), pretty useless for me since I don't inherit any of them. My maternal uncle on the other hand ONLY did the Y-test (result: J1), again the most important test for me is missing.

So here I converted it into a 23andme file. Results:

Markers found (shown as differences to rCRS):

HVR2: 10- 26- 41- 47- 55- 57- 58- 61- 62- 63- 64- 65- 66- 72- 73- 89- 92- 93- 94- 95- 103- 114- 125- 127- 128- 131- 146- 154- 159- 182- 184- 191- 193- 197- 199- 203- 207- 215- 217- 222- 225- 226- 227- 228- 234- 235- 236- 237- 239- 240- 241- 242- 250- 252- 259- 261- 263- 265- 271- 279- 280- 282- 285- 293- 294- 295- 299- 321- 324- 325- 326- 327- 329- 335- 338- 340- 373- 374- 375- 385- 390- 398- 408- 417- 418- 430- 431- 437- 444- 447- 456- 458- 459- 461- 462- 463- 464- 466- 467- 469- 471- 477- 480- 481- 482- 485- 489- 493- 494- 497- 499- 507- 508- 509- 511- 513- (523-) 533- 534- 535- 537- 547- 549- 553- 569- 571- 572-
CR: 583- 591- 593- 597- 606- 613- 629- 644- 654- 656- 663- 669- 676- 678- 680- 681- 710- 711- 719- 721- 722- 723- 732- 735- 739- 740- 742- 752- 789- 793- 794- 813- 825- 850- 851- 856- 862- 868- 869- 870- 896- 921- 930- 942- 951- 953- 954- 959- 961- 978- 979- 980- 988- 990- 1002- 1005- 1007- 1008- 1018- 1040- 1041- 1047- 1048- 1107- 1119- 1148- 1189- 1193- 1222- 1243- 1291- 1303- 1309- 1342- 1382- 1391- 1393- 1406- 1413- 1415- 1420- 1438- 1442- 1452- 1453- 1461- 1462- 1472- 1494- 1503- 1524- 1531- 1536- 1537- 1541- 1555- 1598- 1606- 1618- 1646- 1664- 1686- 1692- 1694- 1700- 1703- 1706- 1709- 1710- 1719- 1721- 1763- 1766- 1780- 1804- 1808- 1811- 1819- 1822- 1836- 1842- 1850- 1872- 1888- 1977- 1978- 2010- 2045- 2056- 2071- 2074- 2080- 2083- 2092- 2141- 2156- 2158- 2159- 2217- 2218- 2220- 2245- 2246- 2251- 2259- 2263- 2282- 2283- 2294- 2308- 2315- 2322- 2330- 2332- 2355- 2358- 2361- 2380- 2387- 2389- 2392- 2397- 2405- 2416- 2417- 2442- 2483- 2526- 2581- 2626- 2639- 2702- 2706G 2707- 2735- 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14485T 14487- 14488- 14495- 14496- 14502- 14518- 14544- 14560- 14566- 14568- 14569- 14584- 14596- 14632- 14634- 14659- 14668- 14674- 14687- 14693- 14696- 14709- 14727- 14743- 14750- 14755- 14757- 14767C 14769- 14783- 14794- 14815- 14819- 14831- 14836- 14845- 14850T 14861- 14866- 14869- 14870- 14871- 14872- 14890- 14893- 14902- 14911- 14914- 14926- 14927- 14935- 14944- 14953- 14978- 14979- 14989- 14990- 14996- 15001- 15010- 15016- 15022- 15024- 15025- 15028- 15031- 15038- 15040- 15043- 15047- 15049- 15055- 15061- 15067- 15071- 15077- 15080- 15090- 15097- 15106- 15110- 15115- 15119- 15136- 15148- 15151G 15172- 15175- 15178- 15191- 15194- 15198T 15204- 15211- 15217- 15218- 15221- 15223- 15226- 15229- 15235- 15236- 15244- 15247- 15250- 15257- 15258- 15259- 15261- 15262- 15263- 15287- 15289- 15301- 15307- 15310- 15311- 15312- 15313- 15314- 15317- 15323- 15334- 15346- 15349- 15355- 15385- 15402- 15412- 15422- 15431- 15440- 15442- 15445- 15451- 15452- 15454- 15458- 15460- 15463- 15466- 15468- 15475- 15479- 15487- 15497- 15498- 15499- 15508- 15511- 15514- 15518- 15519- 15520- 15524- 15530- 15535- 15550- 15553- 15562- 15565- 15601- 15607- 15613- 15617- 15622- 15625- 15626- 15629- 15632- 15644- 15646- 15654- 15658- 15661- 15662- 15663- 15670- 15671- 15672- 15674- 15679- 15682- 15693- 15697- 15703- 15721- 15724- 15734- 15746- 15748- 15754- 15758- 15766- 15769- 15775- 15777- 15784- 15790- 15796- 15799- 15802- 15803- 15805- 15812- 15817- 15820- 15824- 15833- 15839- 15849- 15850- 15851- 15852- 15860- 15862- 15865- 15874- 15883- 15884- 15885- 15889- 15896- 15904- 15905- 15907- 15

What does that mean for me?

[Abti]

Not seeing any positives, you won’t get a result.

[Abti]

@Katarzyna

I suggest getting an FTDNA full MTdna sequence or a standard 23&me test. Obviously this is going nowhere.

Around the holidays is when I would be keen because of the price drop.

[rothaer]

(...)

What does that mean for me?

Convert your AncestryDNA raw data file to the 23andMe format with the DNA Kit Studio and them upload it at James Lick for interpretation like Beowulf wrote.